甲醇对眼睛的毒性早在二十世纪初就已经被发现，其可造成失明的严重后遗症。甲醇的眼睛毒性作用主要发生在视神经节细胞及神经髓鞘，因为代谢物甲酸的累积，抑制了细胞粒线体的细胞色素氧化酶(cytochrome oxidase)功能，而损伤细胞；临床上可出现视觉上的闪光、模糊、色觉异常、甚至发生视野缩小、盲点(scotoma)、甚至视觉丧失的现象，眼睛检查可以发现瞳孔扩张、瞳孔反射异常，以及急性期的视神经盘充血及水肿，终则出现视神经盘萎缩的病灶；视网膜本身一般并无异常特征。 甲醇中毒，除非能及早有所怀疑，否则并不容易被诊断出，立即的治疗主要在于矫正代谢性酸中毒、维持生命征象(vital signs)、减缓及移除甲醇及其代谢等方式(包括使用fomepizole、ethanol、及血液透析等)，即便如此仍然可能留下视觉丧失的后遗症，因此为眼科的急症。 人工糖精阿斯巴甜(aspartame)，商品名包括NutraSweet、Equal、及Canderel等，近年来就被部分人士(Betty Martini's conspiracy theory)诟病，在体内可被代谢成为甲醇及其他物质，因此对身体可能会造成许多伤害(甚至癌症)，而发起反糖精运动；不过目前科学界仍普遍认为在一般剂量下，糖精是安全无虞的。